Сравнение моделей

Таблица 6

Сравнение линейных моделей с разными методами сглаживания

Вид модели

SSE приближения производной

SSE приближения профиля

Средний скор

Среднее время работы (с.)

Ядро (7,15)

0,00102

1,2074

6,1596

0,0137

Ядро (8,15)

0,000994

1,1859

6,3475

0,01355

Сплайн 0.01

0,005909

1,1417

3,2208

0,01218

Сплайн 0.05

0,007406

1,3962

3.0

Сплайн с постоянным весом

0,002

0,5

4.3

0,0116

Стохастическая

-

1,22097

-

0.001

Рисунок 13. Лучший результат для трех моделей

SSE (Sum of Squared Error) - суммарное квадратичное отклонение

Рисунок 14. Худший результат для трех моделей

SSE (Sum of Squared Error) - суммарное квадратичное отклонение

Далее будем изучать работу ядра с параметрами 8,15, “коридорного” сплайна с погрешность 0.01 и сплайна с постоянным весом. Ясно, что имеет смысл сравнивать модели только на тех генах-мишенях, выбор регуляторов для которых совпал у различных моделей.

Стохастическая модель несет в себе больше биологического смысла за счет моделирования процесса транскрипции с помощью сигма-функции, учитывающей процесс насыщения (т.е. с начиная с какого-то момента увеличение уровня экспрессии регулятора больше не влияет на уровень экспрессии гена-мишени) и добавленной случайной погрешности, которая в эксперименте неизбежна. Кроме того, стохастическая модель требует значительно меньше времени на построение. Однако серьезным недостатком является значительная потеря точности при дискретизации модели, как видно из таблиц 6 и 7, точность стохастической модели хуже, чем у линейной при сглаживании ядром. В таблице 7 приведены результаты для 6 лучших приближений с помощью линейной модели (среди всех случаев, когда 3 варианта реализации выбирали один и тот же регулятор) В приложении 2 на рисунках П2.1-П2.6 приведены соответствующие графики. Видно, что в некоторых случаях стохастическая модель выбирает тот же регулятор, что и линейная, однако чаще они различны и слабо коррелированны.

Таблица 7

Суммарные квадратичные ошибки и AIC для линейных и стохастических моделей регуляции генов

Ген-мишень

Ядро (8,15)

“Коридорный” сплайн

Сплайн с постоянным весом

Стохастическая модель

AIC

YDR225W

2,257

1,782

1,3844

2,312

-18,3794

YML034W

1,13188

0,29515

0,35275

3,3949

-34,5137

YGL192W

5,7415

0,5534

0,25269

0,6442

-41,301

YPL141C

0,7017

0,597962

0,46421

4,16162

-22,2028

YMR232W

14,2411

3,89097

2,2747309

2,52127

-10,5695

YDR150W

1,8640

0,36604

0,375060

0,46466

-44,0042

Перейти на страницу:
1 2 3

 

Как стать лидером

На каком основании людей избирают лидерами, либо позволяют им становиться таковыми? Для объяснения этого явления был разработан ряд теорий, однако последние исследования сосредоточены на так называемых имплицитных теориях лидерства.

Анализ потребителей

Для успешной работы фирмы на рынке необходимо не только определиться с целями, но и понять, как их можно достичь. Для этого надо очень хорошо изучить своего потребителя, а может, даже и создать новый тип потребителя.

Выбор карьеры

Прежде всего менеджеру необходимо определить какой вид карьеры он предпочитает. Это и определит его стратегию. Если он менеджер знает, какое положение хочет занять через пять или даже десять лет, то можно определить направление действий и составить задачи, которых необходимо достичь.