Замечание.Во всех случаях мы будем получать так называемый скор (score). Величину, которая будет давать нам информацию о том, насколько значимо изменилась экспрессия и, соответственно, какова вероятность того, что экспрессия изменилась исключительно по случайным причинам.
. Статистика Стьюдента
Этот критерий предназначен для проверки гипотезы однородности средних значений в двух выборках, извлеченных из нормальных генеральных совокупностей:
- первая выборка значений экспрессии для гена,
- вторая выборка значений экспрессии для гена,
имеющих одинаковую (хотя и неизвестную) дисперсию . В качестве критической статистики в данном критерии используется величина:
где
,
- соответствующие выборочные средние,
,
соответствующие выборочные дисперсии,
- математические ожидания распределений, описывающих вероятностный закон, которому подчиняются наблюдения соответствующей выборки.
При справедливости гипотезы однородности средних , для выборок с указанными свойствами, статистика должна подчиняться распределению Стьюдента с степенями свободы.
Таким образом, используя двухсторонний критерий, P-значение вычисляем по формуле:
В случае, когда проверяемая и контрольная группы представляют собой связанные данные (например, после воздействия некоторого и до него) применяется критерии Стьюдента для связанных выборок [3]:
Окончательно, получаем:
Минусами этого метода являются: предположения нормальности данных и равенства дисперсий. Коме того, сам характер метода подразумевает сравнение средних, что не всегда правомерно для решения исходной задачи.
Плюсами метода является низкая вычислительная сложность и простота алгоритма. Кроме того для проведения теста достаточно иметь по три элемента в каждой выборке, что важно поскольку данные о замерах в одних и тех же условиях (в один момент времени, например), часто содержат малое количество значений.
. Критерий ранговых сумм Вилкоксона
Свободный от распределения критерий суммы рангов для гипотезы об отсутствии эффекта обработки.
Перейти на страницу: 1 2 3 4
|